예부터 충청도, 경상도, 전라도를 삼남이라고 했는데 삼남에서 으뜸이 되는 서원이 바로 청주 신항 서원이다. 충청북도 청주시 상당구에 위치해 있고 4인의 선현을 추모하기 위해 창건한 서원이며 조선 시대의 교육기관이다. 선조 3년(1570)에 지방 유림에 의해 경연, 박훈, 김정, 송인수의 학문과 덕행을 추모하기 위해 창건 후 위패를 모셨으며, 그 뒤에 한충, 송상현, 이색, 이이, 이득윤의 위패를 추가하여 모셨다. 임진왜란 때 훼손되었으나 복원하였다. 선현 배향과 지방 교육의 일익을 담당하여 오던 중 흥선대원군의 서원철폐령으로 고종 8년(1871))에 철폐되었다. 광복 후 지방 유림들의 요청으로 당시 충청북도 지사 정낙훈과 청원 군수 서정국이 출자하여 복원하였으나 시설이 미약하고 퇴락하여, 1985년 유용기 비롯한 유림의 협력으로 다시 중건하였다.
경내의 건물로는 4칸의 사우, 중앙의 신문과 양옆 협문으로 된 내삼문, 6칸의 재실 겸 강당, 5칸의 수호사, 묘정비각, 외삼문, 정문 등이 있다. 매년 3월 초정과 9월 초정에 향사를 지내고 있으 1977년 충청북도 시도유형문화재로 지정되었다. 보관 중인 유물로는 서원향약, 배향된 아홉 선현의 약력 등이 있다.