영주시 단산면 사천리에 있는 구고서원은 1780년(정조 4)에 지방 유림의 공의로 서한정의 학문과 덕행을 추모하기 위해 서원을 창건하여 위패를 모신 곳이며, 선현에 대한 제사와 지방민의 교육을 담당하던 중 1868년(고종 5) 흥선대원군의 서원철폐령으로 훼철되었다. 이후 구고서당으로 현판을 바꿔 달고 영주군 단산면 구구리에 건립하고, 운영하였으나 관리 부실로 퇴락이 심하여 1974년 종택이 있는 영주군 단산면 사천리 새내마을로 이건하고, 구고서원으로 승격시켰다.
경내에는 서한정의 위패를 모신 사당인 상절사를 비롯하여 전사청, 강당, 책실 등이 남아 있고, 매년 음력 3월과 9월 중정일에 향사를 지내고 있다. 책실에 있던 서적과 책판은 현재 소수박물관에 보관되어 있다.